系统和软件

什么是质谱分析以及如何应用于你们的系统中?

质谱分析是一种分析化学技术,可通过测量质荷比以及气相离子的丰度界定样本中分子的数量和类型。

Agena Bioscience采用一种特定类型的质谱分析——基质辅助激光解吸/电离飞行时间(即MALDI-TOF)质谱分析。尽管MALDI-TOF质谱分析广泛用于肽质量指纹图谱分析等蛋白质组学应用,但Agena Bioscience却是少数几家在基因组应用中采用MALDI-TOF质谱分析法分析核酸的公司之一。

此技术的应用以及对核酸的直接检测让使用MassARRAY®系统能够拥有较高的多重检测能力以及高灵敏度。

MassARRAY系统包含哪些内容?

MassARRAY系统包含质谱仪、计算机/服务器和分析软件。使用系统96孔和384孔板形式的客户通常还将获得RS1000微量点样系统。

MassARRAY系统可处理多少份样本?

MassARRAY系统通量基于检测设计以及所使用的SpectroCHIP®阵列(芯片)而定。MassARRAY系统每次可处理2个芯片。

芯片分为下列三种形式:24孔、96孔或384孔。如果检测设计要求采用单孔,则一次可处理的样本数量从384孔板形式的768个到24孔板形式的48个不等。

MassARRAY系统提供哪些维护服务?

每个新系统均附含一年质保和一年维护服务。质保与维护服务期限可延。请联系客户支持了解详情。

什么是RS1000微量点样系统?

RS1000微量点样系统是一个自动化平台,可将被分析物从微量滴定板转移至SpectroCHIP阵列中。

MassARRAY系统的24孔板形式包含RS1000微量点样系统吗?

不包括,24孔板形式要求手动分配0.75微升容量。RS1000微量点样系统目前适用于需要纳升容量的96孔板和384孔板形式。

什么是SpectroCHIP阵列?

SpectroCHIP阵列(芯片)是我们专有的芯片技术,当PCR和延伸/裂解步骤完成后,被分析物就将转移到此芯片上。芯片分为下列三种形式:24孔、96孔或384孔。

什么是栅格?其如何使用?

栅格是SpectroCHIP阵列样本底板上的一个点,MassARRAY系统的激光将对准其发射。如要获得适合分析的质谱,每个样本底板均必须经过系统软件认定,获得至少5个“良好”的栅格点。

如何访问在线检测设计网络版软件?

Agena Bioscience的所有客户均可登录www.agenacx.com在线访问检测设计网络版软件。

Assays by Agena服务

你们可如何帮助我设计新的检测方法?

我们的Assays by Agena科学家在使用MassARRAY系统的相关产品和应用方面拥有广泛的知识和实际操作经验。 Assays by Agena服务可满足您在下列领域的测试需求:

  • 基因分型
  • 体细胞突变分析
  • DNA甲基化分析
  • 基因表达定量分析和拷贝数变异分析

平均周转时间:4-6周。

Agena Bioscience会帮助我在常规检测中实施新的检测方法吗?

会。我们向客户提供各种服务以验证您新的Agena Bioscience检测方法,同时尽量避免中断您的常规检测,从而对客户提供支持。

应用与试剂

你们目前支持哪些类型的应用?

目前我们支持下列应用:

  • iPLEX®试剂在基因分型、体细胞突变和定量检测等方面的应用
  • 利用UltraSEEK试剂实现超高灵敏度体细胞突变分析
  • 采用MassCLEAVE试剂的DNA甲基化分析和病原体检测

我们的科学家始终努力改善现有的化学试剂与其他试剂,以便提供新的应用。请务必时常回访网站,查看最新资讯动态。 访问我们的“应用”页面,了解有关我们所提供试剂类型的更多信息。

质谱分析的样本如何制备?

若要制备用于MassARRAY系统的样本,实验室应当遵守标准的终点定量PCR程序。其中包括:DNA提取、靶区扩增、延伸以及脱盐,再将产生的被分析物转移至SpectroCHIP阵列,用于MassARRAY Analyzer 4中。

试剂盒

预先设计的试剂盒与您的一般试剂有何区别?

Agena Bioscience预先设计的试剂盒经过我们的研发机构配制和完善,可用于特定用途。试剂盒为即用型,您的实验室能够立即将其投入使用。

你们提供哪些类型的试剂盒?

我们提供广泛的即用型试剂盒,覆盖多个重点领域,其中包括:癌症、药物基因组学(PGx)、血型鉴定和样本鉴定。欲知有关Agena Bioscience各种试剂盒的详细信息,请访问我们的试剂盒页面

癌症

你们提供哪些癌症试剂盒?

我们提供八种癌症试剂盒。其中包括:

  • UltraSEEK超高灵敏度肿瘤基因突变检测试剂盒v1.0,可对异质性肿瘤和血液样本中频率低于1%的12种主要癌基因的26种体细胞突变进行筛查。
  • OncoFOCUS重点肿瘤基因突变检测试剂盒v1.0,可筛查与确认EGFR、KRAS、NRAS和BRAF中超过300种高相关性体细胞突变。
  • OncoCarta试剂盒v1.0,可筛查19种常见癌基因中的238种体细胞突变。
  • OncoCarta试剂盒v2.0,可筛查18种癌症基因和肿瘤抑制基因中的152种体细胞突变。
  • OncoCarta试剂盒v3.0,可筛查22种癌症基因中的105种体细胞突变。
  • LungCarta®试剂盒v1.0,可评估非小细胞性肺癌的26种癌基因以及肿瘤抑制基因中的214种体细胞突变。
  • MelaCarta试剂盒v1.0,可使用此涵盖20种基因中超过70种体细胞突变的定向发现试剂盒筛查黑色素瘤样本。
  • GyneCarta试剂盒v1.0,可使用此涵盖13种基因中168种热点突变的定向发现试剂盒筛查妇科肿瘤样本。
  • LungFUSION试剂盒,可筛查非小细胞性肺癌中的ALK、RET或ROS1易位。
  • ALK融合变异体试剂盒,可筛查非小细胞性肺癌和其他类型癌症中的11种EML4-ALK和2种KIF5B-ALK易位以及2个ALK体细胞突变。

欲知有关这些试剂盒的更多信息,请访问我们的“癌症试剂盒”页面

你们的癌症试剂盒兼容哪些组织类型?

癌症试剂盒产品系列专为有针对性的高度多重反应分析而设计,可用于分析福尔马林固定组织、细针穿刺和血浆等各种肿瘤来源的样本。

药物遗传学(PGx)

你们提供多少种药物遗传学试剂盒?

我们目前提供五种药物遗传学(PGx)试剂盒。其中包括:

  • iPLEX PGx Pro试剂盒检测36种关键基因的191种SNP,这些基因包括CYP2C9、CYP2C19、CYP2D6和UGT1A1。
  • PGx 68试剂盒检测16种基因和5种CNV检测中的63种SNP,涵盖每种基因中多数重要的单倍型。
  • CYP2C9 / VKORC1试剂盒检测CYP2C9中的36种SNP以及VKORC1中的9种SNP。
  • CYP2C19试剂盒包含针对31种SNP的检测,涵盖多数已知的CYP2C19单倍型。
  • CYP2D6试剂盒整合了30种SNP和5种CNV检测方法,涵盖大部分已知的CYP2D6单体型。

欲知有关这些试剂盒的更多信息,请访问我们的“药物遗传学试剂盒”页面

血型鉴定

你们提供多少种血型抗原基因分型试剂盒?

我们目前提供一种包含八种不同模块的试剂盒。模块包括:

  • Hemo ID DQS模块检测那些常用于筛查献血者DNA样本的各种标记物,以识别稀有血型献血者。
  • Hemo ID血型基因分型检测试剂盒包括除DQS模块以外的所有其他模块。
  • Hemo ID Kell、Kidd、Duffy模块检测Kell、Kidd和Duffy血型系统的基因和变异型。
  • Hemo ID MNS模块检测MNS血型系统的变异型。
  • Hemo ID稀有血型模块检测Lutheran、Diego、YT等其他血型系统的变异型。
  • Hemo ID RHD-CE广泛型模块检测Rh血型系统的基因和变异型,包括对RhD基因的拷贝数变异检测。
  • Hemo ID RHD变异型模块检测RHD血型系统中的其他变异型。
  • Hemo ID HPA/HNA模块检测人体血小板(HPA)和中性白细胞(HNA)抗原。

欲知有关这些试剂盒的详情,请访问我们的“血型鉴定试剂盒”页面

样本鉴定

你们提供多少种样本鉴定试剂盒?

我们目前提供两种样本鉴定试剂盒。其中包括:

  • iPLEX Pro样本鉴定试剂盒检测在六种主要的HapMart人群中选择的异质性为45-55%的44种SNP、用于性别识别的3种标记物以及用于样本量化的5种标记物。
  • iPLEX Pro Exome ID外显子样本鉴定试剂盒检测44种SNP、3种用于性别识别的标记物以及5种拷贝数标记物,并将其融入单个多重反应检测中。拷贝数标记物涵盖了100-500 bp的范围,可对外显子测序工作流程中常见的因样本制备而导致的潜在降解进行评估。

欲知有关这些试剂盒的更多信息,请访问我们的“样本鉴定试剂盒”页面

你们的样本鉴定试剂盒兼容哪些组织类型?

样本鉴定试剂盒兼容多数样本类型。最常见的样本包括:

  • 从血液中提取的DNA
  • 来自福尔马林固定和冰冻组织样本中的DNA
  • 从血浆和血清中分离的DNA
  • 来自FTA卡的DNA
  • 全基因组扩增的DNA
  • 口腔DNA