Agena Bioscience的软件拥有简单、灵活而稳健可靠的功能,您既可以设计自己的检测,也可以获得易于用户理解的报告以用于下游数据分析。

快速的检测设计

基因分型和突变检测

在线检测设计(ADS)是一款在线工具,用于设计基因分型和突变检测,以结合Agena Bioscience的MassARRAY®系统和我们的iPLEX®、iPLEX HS和UltraSEEK™试剂盒一起使用。

ADS提供了自动、灵活的设计工具:
  • 使流程自动化——无须担心PCR或质谱分析的引物设计准则。
  • 所有检测采用通用的热循环条件。
  • 快速的检测开发,第一轮运行后成功率>80%。
  • 随着研究或需求的变化而添加或排除特定突变。
  • 可为新的使用者和有经验的使用者提供PCR引物设计协助。
  • 导出检测设计报告,以加速寡核苷酸订单的交付。
ADS工作流程摘要:
  1. 检索序列并确定序列的格式
    从NCBI dbSNP、FASTA文件或SNP组文件中导入RS号。
  2. 查找邻近的SNP
    将SNP序列与指定的基因组相匹配,并使用非常接近指定检测的注册SNP来重新确定序列的格式。
  3. 识别最佳的引物区域
    重新确定SNP序列的格式,以取消标记将会产生独特产品的PCR引物。
  4. 设计检测
    生成多重反应检测。在单个反应孔中,基因分型检测的多重反应水平可达40重,体细胞突变检测可达15重。
  5. 验证
    分析多重反应设计,以识别意外的交叉扩增,从而避免在分析过程中出现假阳性。

可管理的结果

MassARRAY系统包含Typer软件,这是一个集成化的数据分析工具,使您能够轻松评估和管理结果。

  • 自动生成报告
  • 以表格和图形的形式显示数据
  • 使用聚类分析
  • 自动错误检查

易于使用的交互式HTML报告使您能够轻松查看可视化结果,并挖掘更加详细的数据。

软件

其他应用

甲基化分析

EpiDesigner是一个在线工具,用于为Agena Bioscience的EpiTYPER®技术设计量化DNA甲基化实验。此程序为经亚硫酸氢盐处理的基因组DNA提供了简便的引物设计,同时也可以为各种检测推荐引物对。